MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 2327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009932	GTT	2	6	132657	132662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341483
2002	NC_009932	CTT	2	6	132672	132677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341483
2003	NC_009932	CAA	2	6	132698	132703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341483
2004	NC_009932	CAG	2	6	132716	132721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341483
2005	NC_009932	GAGG	2	8	132741	132748	25 %	0 %	75 %	0 %	158341483
2006	NC_009932	TAA	2	6	133360	133365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341484
2007	NC_009932	GGT	2	6	133409	133414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341484
2008	NC_009932	AAGG	2	8	133430	133437	50 %	0 %	50 %	0 %	158341484
2009	NC_009932	CATC	2	8	133441	133448	25 %	25 %	0 %	50 %	158341484
2010	NC_009932	T	6	6	133527	133532	0 %	100 %	0 %	0 %	158341484
2011	NC_009932	ATT	2	6	133550	133555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341484
2012	NC_009932	T	6	6	133604	133609	0 %	100 %	0 %	0 %	158341484
2013	NC_009932	TAA	2	6	133684	133689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341484
2014	NC_009932	AAT	2	6	133694	133699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341484
2015	NC_009932	ATT	2	6	133727	133732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341484
2016	NC_009932	AT	3	6	133793	133798	50 %	50 %	0 %	0 %	158341484
2017	NC_009932	TTC	2	6	133856	133861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341484
2018	NC_009932	AGAT	2	8	133879	133886	50 %	25 %	25 %	0 %	158341484
2019	NC_009932	TAT	2	6	133907	133912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341484
2020	NC_009932	T	7	7	133918	133924	0 %	100 %	0 %	0 %	158341484
2021	NC_009932	GAA	2	6	133934	133939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341484
2022	NC_009932	TGC	2	6	134002	134007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341485
2023	NC_009932	GTG	2	6	134021	134026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341485
2024	NC_009932	AGA	2	6	134058	134063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341485
2025	NC_009932	TAG	2	6	134219	134224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341486
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2027	NC_009932	CTTT	2	8	134500	134507	0 %	75 %	0 %	25 %	158341486
2028	NC_009932	CTGC	2	8	134685	134692	0 %	25 %	25 %	50 %	158341487
2029	NC_009932	CTG	2	6	134714	134719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341487
2030	NC_009932	CAGCC	2	10	134727	134736	20 %	0 %	20 %	60 %	158341487
2031	NC_009932	GAC	2	6	134737	134742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341487
2032	NC_009932	CGC	2	6	134790	134795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341487
2033	NC_009932	GTTG	2	8	134859	134866	0 %	50 %	50 %	0 %	158341487
2034	NC_009932	TGGA	2	8	134888	134895	25 %	25 %	50 %	0 %	158341487
2035	NC_009932	CTG	2	6	134972	134977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341487
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2037	NC_009932	TCTG	2	8	135025	135032	0 %	50 %	25 %	25 %	158341487
2038	NC_009932	G	6	6	135032	135037	0 %	0 %	100 %	0 %	158341487
2039	NC_009932	GCA	2	6	135146	135151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341488
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2041	NC_009932	GTT	2	6	135186	135191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341488
2042	NC_009932	TGA	2	6	135331	135336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341488
2043	NC_009932	TGA	2	6	135380	135385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341488
2044	NC_009932	CT	3	6	135502	135507	0 %	50 %	0 %	50 %	158341488
2045	NC_009932	A	6	6	135530	135535	100 %	0 %	0 %	0 %	158341488
2046	NC_009932	TGG	2	6	135548	135553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341488
2047	NC_009932	CAATA	2	10	135636	135645	60 %	20 %	0 %	20 %	158341488
2048	NC_009932	GTT	2	6	135650	135655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341488
2049	NC_009932	A	7	7	135714	135720	100 %	0 %	0 %	0 %	158341488
2050	NC_009932	GTG	2	6	135726	135731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341488
2051	NC_009932	GAT	2	6	135740	135745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341488
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2054	NC_009932	CAA	2	6	136021	136026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341488
2055	NC_009932	TGG	2	6	136102	136107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341488
2056	NC_009932	GAC	2	6	136121	136126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341488
2057	NC_009932	TGC	2	6	136235	136240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341488
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2059	NC_009932	GTG	2	6	136320	136325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341488
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2062	NC_009932	GTC	2	6	136538	136543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341489
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2072	NC_009932	TTGT	2	8	136981	136988	0 %	75 %	25 %	0 %	158341489
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2079	NC_009932	CTTT	2	8	137265	137272	0 %	75 %	0 %	25 %	158341489
2080	NC_009932	CAAG	2	8	137317	137324	50 %	0 %	25 %	25 %	158341489
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2093	NC_009932	CAA	2	6	138326	138331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341491
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2109	NC_009932	ATC	2	6	139385	139390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341491
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2123	NC_009932	CCG	2	6	140605	140610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341491
2124	NC_009932	AGT	2	6	140816	140821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341491
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2126	NC_009932	TAT	2	6	140961	140966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341491
2127	NC_009932	GA	3	6	140982	140987	50 %	0 %	50 %	0 %	158341491
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2129	NC_009932	GCT	2	6	141098	141103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341491
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2145	NC_009932	ACT	2	6	142824	142829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341493
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2247	NC_009932	TCG	2	6	149412	149417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341501
2248	NC_009932	TCA	2	6	149911	149916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341502
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2250	NC_009932	GCA	2	6	149939	149944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341502
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2283	NC_009932	CAA	2	6	151937	151942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341502
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2285	NC_009932	GTC	2	6	152008	152013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341502
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.